水利水电系统高校有26所，共11所普通本科院校，15所职业专科院校，以教育部直属的河海大学为最高学府，是双一流大学，另设有河海大学常州校区，前身是水利电力部直属的常州电力机械厂机械职工大学。黄河水利职业技术学院、安徽水利水电职业技术学院和广东水利电力职业技术学院3校为双高计划建设职业院校。

全国开设水利水电工程专业三本院校共16所：兰州交通大学博文学院、太原理工大学现代科技学院、河北工程大学科信学院、昆明理工大学津桥学院、贵州大学明德学院、青海大学昆仑学院、天津大学仁爱学院、湖南农业大学东方科技学院、三峡大学科技学院、兰州理工大学技术工程学院、新疆农业大学科学技术学院、河北农业大学现代科技学院、长沙理工大学城南学院、成都理工大学工程技术学院、扬州大学广陵学院、河海大学文天学院。水利水电工程专业主要培养适应现代水利、沿海都市水利及城乡水利发展需要，具有水利水电工程勘测、规划、设计、施工、科研及管理方面的专业知识和技能，能在水利、水电等部门从事勘测、规划设计、施工、科研、管理、技术经济分析，并具有一定创新能力的应用型工程技术人才。